Y'a pas tellement de conseil à donner, il suffit de faire tes conf et de récup tes fichiers de conf et de les placer dans
/kali-config/common/includes.chroot/{etc,lib,root,usr}
puis de tester en machine virtuelle.
Au début il faudra build et rebuild plusieurs fois car on oublie toujours un truc ou l'autre, mais ensuite il suffit de rebuild pour les mises à jours avec les même config.
Un conseil oui, évite d'ajouter les dépôts style ppa d'ubuntu ou destiné à de mauvaise version de debian (wheezy, lenny), ça fout en l'air le système.